生殖器疱疹虽然是特别严重的疾病，但是在治疗上，患者可能会走一些错误的道路，比如到小诊所进行治疗，进行不彻底的治疗等，这些都是造成生殖器疱疹的复发的主因之一。因此生殖器疱疹的治疗要正规。
有许多患者对生殖器疱疹没有正确的认识，很可能会不重视疾病，或者被表面现象迷惑，没有得到彻底根治。如生殖器疱疹常规采用传统的抗病毒类药物及化学疗法只是治标，不能治本。而使用抗干扰素等被动疗法只能抑制病毒复制，不能彻底清除掉存在于血液组织细胞核中的病毒，停药后极易复发。
还有患者之所以会出现复发，是因为用药不正规等原因而造成的。有些患者治疗过程中存在轻视急躁心理，没有按疗程用药或自己乱用药乱买药，导致耐药性的发生及身体毒副作用，出现复发的现象。
可见，生殖器疱疹的治疗如果不正规或不彻底，是很容易使患者在治疗过后出现复发现象的。因此不管是用药还是其它的治疗，患者都要遵从大夫的医嘱，一定要坚持按疗程进行治疗，可以有效杜绝复发。