生殖器疱疹总治不好是什么原因？生活中有很多生殖器疱疹的患者，这不是什么不可治疗的疾病，但是很多患者经过长时间的治疗还是没有治好，生殖器疱疹治疗十分的困难。
一、很难攻克
通过观察，该疾病致病毒、Ⅱ型单纯疱疹的病毒潜伏于神经节内，麻痹机体免疫调节机能，在机体各项免疫机能正常时时蛰伏待机，当机体调节机能紊乱，因炎症等免疫功能低下时，病毒迅速激活，危害组织器官，在治疗上药物很难从神经节内清理病毒，治疗同时对自身的损伤也较大。
二、防御功能失常
经过临床诊断观察，发现Ⅱ型单纯疱疹病毒变异后可进行自我伪装，让机体无法识别，或者释放假信号避免药物和免疫系统对它的杀灭作用，给治疗带来很大不变，即使治好也可能是暂时性的一种假象，很容易再次复发。
三、多合并疾病
在治疗过程中，该疾病往往不是单独发病，一般都是在其它炎症或隐性感染后发病。而在实际治疗中大多被忽视，这样给复发和病毒转移提供了客观因素。
四、免疫力弱
一般情况下，患者的自身免疫力差，在经综合治疗，少数残余的病毒发生变异，人隐藏于神经细胞内，当患者免疫力下降时，如生病、发热、酗酒、劳累时，潜伏的病毒重新复活，开始繁殖，然后大量复制出新病毒，又沿神经轴返回皮肤黏膜，引起新的疱疹，病灶逐渐扩大，从而出现疱疹复发。