医院设备先进齐全，目前医院拥有万元以上医疗设备共693台，设备总价值达1.3亿元。包括GELightspeed16层螺旋CT、GE1.5T双梯度核磁共振系统、GE数字影像Ｘ光机（DR）、血管造影Ｃ臂Ｘ光机（DSA）、菲利普SONOS7500实时三维心脏彩色多普勒超声诊断仪、菲利普飞凡影像彩色超声系统、全自动生化分析仪、荧光定量PCR仪、全自动化学发光免疫分析仪、中央监护系统、百特连续性床旁血滤机（CRRT）、史托克ＳⅢ人工心肺机、奥林巴斯电子腹腔镜及宫腔镜、史赛克关节镜、富士电子胃镜及电子支气管镜、西诺德高档牙科综合治疗台、德国鹰视准分子激光治疗仪、TOPCON光学相干断层扫描仪（OCT）、日本免散瞳眼底照相机CR-DGI、德国罗兰电生理传统多焦一体机RETI-portscan、瑞士HA-BQ900高档数码裂隙灯等一大批国际领先的医疗设备。
医院树立“科教兴医”的思想，重视科教工作，进一步完善科研管理、科研奖励制度并狠抓落实，形成了“科教兴院”的良好氛围，近10年获得国家专利的16项，获得科技成果40多项；获得广东省科技奖励1项，佛山市科技奖励26项；获各级科研课题191项，其中国家自然科学基金项目1项、广东省科技厅项目3项、广东省卫生厅课题14项、广东省中医药局课题10项、佛山市科技局项目71项、佛山市卫生局课题142项；获得科研经费134.3万元。
2001年通过了广东省高等医学院校教学医院评审，医院内、外、妇、儿、眼、耳鼻喉、麻醉等科室经省卫生厅审定，成为广东省临床住院医师规范化培训基地，佛山市企业博士后站临床综合实验室、佛山市眼科研究所和中国康复医学会广东修复重建委员会均设在佛山市第二人民医院。2003年7月，佛山市第二人民医院被广东医学院批准为该院硕士研究生联合培养基地。眼科为佛山市首批重点专科，心内科、耳鼻咽喉科为佛山市首批特色专科。
目前，医院能开展各种医疗辅助检查和治疗各种疑难病症，具有先进的急救设备和较高的急救水平，已形成了院有重点，科有特色，人有专长的强有力的技术格局。已形成了一个设备先进、技术领先、科室齐全、环境优美的大型现代化综合医院。近年，医院在党委的正确领导下，在全院职工的共同努力下，医院各方面的建设日新月异，正逐步朝着医院确定的“精品医院”的目标迈进。