医院始建于1866年，前身为英国皇家海军、英国领事馆合办的“海港医会馆”。1887年易名为“福建省塔亭医院”。新中国成立后，更名为“福州市第二医院”，1984年增挂名为“福建省福州中西医结合医院”。医院集医疗、科研、教学、预防、康复为一体，以骨伤科为龙头的综合性医院，1997年1月1日被评为中西医结合三级甲等医院、全国重点中西医结合医院建设基地。
全院占地面积26146平方米，建筑面积80335平方米，固定资产总额计27890万元。医院现有编制床位数1300张（2011年9月核批），实际开放1200张。现有职工1438名，卫技人员1277人，占全院职工的88.8%，中高级以上职称442人，占卫技总数的34.6%。硕士90人，博士8人。医院设有31个临床科室，9个医技科室。
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