男性乳腺增生的治疗按照治疗方法可分为，中医治疗，西医治疗，食疗。
中医治疗
以郁怒伤肝、思虑伤脾、气滞血淤、痰凝成核所致的男性乳腺增生为治疗契机，正确处理协调身体内，从而使内分泌激素正常的理论基础的为中医治疗。
西医治疗
乳腺增生的发生，发展和转归，完全是由于人体内的激素周期性变化所导致。当雌激素水平过高，黄体孕激素过少，或者这两者分泌不协调，就可以引起乳腺导管上皮细胞和纤维组织增生。以补充激素以达到稳定内分泌系统的理论为依据成为西医治疗。
食疗
以食物达到补充，稳定情怀，使肝气得以正常疏泻而气不滞血淤疾不凝，冲任协调的目的，或使身体得以调理的办法。
男性乳腺增生的治疗按照心理认知可分为先天性男性乳腺增生的治疗和后天性男性乳腺增生的治疗。
先天性男性乳腺增生的治疗
由遗传因素诱发的乳腺增生称之为先天性男性乳腺增生的治疗，有理论上有两种治疗方法，其一是改变基因，是基因的排列组合恢复正常，现在还很难实现，另一种是根据身体内激素的平衡原理，使身体内各个元素达到平衡。
后天性男性乳腺增生的治疗
由婚育、膳食、人生存的外环境所造成的乳腺增生则称之为后天性男性乳腺增生的治疗，这样治疗的方法也是分为两种，一种是找出乳腺增生的诱因，改变诱因条件来达到治疗的目的，另一种是单纯的依据病情的状况，“对症下药“不过这样治疗容易复发。