生殖器疱疹的病因是什么呢？这一问题困扰了很多的人，这也是大多数患有生殖器疱疹的人和大部分没患生殖器疱疹的人都想知道的问题。
（一）西医病因
生殖器疱疹的病原体为单纯疱疹病毒(HSV)，或称人类a疱疹病毒，是直径为150～200nm中等大小的DNA病毒，它包含一个75nm直径的双链DNA核心，其外有一蛋白质衣壳(直径约100nm)包绕。衣壳为-20面体，由162个壳微粒组成，外有含脂质的包膜。
感染HSV后，HSV可在感染者中持续存在，因其有逃避宿主防御的机制：①HSV可在细胞间传播而不需进入细胞外环境；②可使神经节细胞发生潜伏性感染；③可逃避宿主的自然防御系统，即巨噬细胞、自然杀伤细胞及干扰素。但宿主至少有三种免疫应答来消除HSV，即抗体，特异性细胞毒性T细胞及特异性迟发超敏反应。
抗体可阻止持续性感染的建立，抗体水平高时可阻止病毒侵犯神经系统。首次感染HSV后，4～6周抗HSV抗体升到高峰，并在其后保持稳定，早期产生HSV特异的lgM抗体，可持续6～8周。过去已受感染而存在抗体者，复发或再感染(同型或另一型HSV)时，抗体滴度均无明显变化，而且不出现IgM抗体。
（二）中医病因
1．房事不洁：男女之间婚外不洁的性生活是引起生殖器疱疹最直接原因。间接接触受污染物品虽亦可引起本病发生，但机会较少。
2．外受湿热邪毒：由于不洁房事，外阴皮肤黏膜腠理疏松或破损，淫毒之邪乘虚而入；加之机体本身素有湿毒蕴结下焦，淫毒和湿毒之邪搏结于外阴，郁而化热化火，以致出现水疱、糜烂和灼热疼痛。
3．正虚邪恋：由于湿热淫毒为阴邪，其性黏滞固着，易困结于下焦，形成伏邪，难以清解。每遇过劳，饮食不节，房事过度而致湿热淫毒循经走窜，流于肌肤。邪毒久伏，反复发作易伤精耗气，引起肝肾阴虚，脾失健运，正虚邪恋。