肛瘘手术方式需要根据瘘管位置、深浅、走行以及是否累及肛门括约肌来选择。常见方式包括肛瘘切开术、肛瘘切除术、挂线疗法、括约肌间瘘管结扎术、瘘管剔除术等。

　　低位单纯性肛瘘常可采用切开或切除方式，把瘘管开放，使创面从底部逐渐愈合。高位复杂性肛瘘则更谨慎，因为瘘管可能穿过较多括约肌，直接切开可能影响控便功能，医生常会结合挂线治疗，逐步切割或引流。

　　挂线疗法分为切割挂线和引流挂线。切割挂线通过缓慢勒割组织，减少一次性切开带来的损伤;引流挂线则主要用于控制感染、保持引流通畅，为后续治疗创造条件。

　　近年来也有一些保留括约肌的术式，适用于部分复杂性肛瘘，但并非所有人都适合。选择术式时，医生会综合评估复发风险、控便功能和术后恢复。

　　术后护理同样重要，包括按时换药、温水坐浴、保持大便通畅、定期复查。肛瘘术后创面愈合时间较长，需要耐心配合。