如果患者确诊为肺脓肿后，要根据感染途径，使用不同的消炎药，同时要积极地完善痰培养的检查，根据痰培养的结果，更换抗生素。

如果患者为吸入性导致的肺脓肿，考虑为厌氧菌感染，需要使用对厌氧菌有效的青霉素族抗生素，可联合应用甲硝唑、奥硝唑、克林霉素等相关抗原的药物。

如果患者为血源性肺脓肿，考虑有需氧菌或者是金黄色葡萄球菌，可使用二代头孢、三代头孢、或者联合使用酶抑制剂，例如头孢哌酮钠舒巴坦钠、美洛西林钠舒巴坦钠。

如果患者考虑为耐酶的金黄色葡萄球菌，可使用，万古霉素、利奈唑胺、利福平等相关的抗生素。

肺脓肿是肺组织坏死形成的空腔，一般为病原菌感染导致肺组织坏死，治疗肺脓肿最常见的，也是最选择的方法是抗生素治疗。

根据引起肺脓肿病原菌的不同，选择的抗生素也不同。吸入性肺脓肿多合并厌氧菌感染，一般对青霉素敏感，少部分对青霉素不敏感的病原菌如脆弱拟杆菌可选用林可霉素、克林霉素或甲硝唑治疗；血源性肺脓肿多为葡萄球菌和链球菌感染可以选用敏感的青霉素或头孢菌素。

如果是甲氧西林耐药的金葡菌感染应该选用万古霉素或替考拉宁，如果是阿米巴原虫感染则用甲硝唑治疗。