卵巢囊肿分生理性和病理性，生理性囊肿会随着月经周期而发生不同的变化，一般情况下，3-6个月会自行消退或缩小。如果是病理性囊肿则要对症治疗，一般如果囊肿小于6cm需要先观察，定期到医院复查，大于6cm就需要住院手术治疗了。主要的治疗方法有以下几种：
1 、保守治疗法 祖国医学认为此病的发生多由七情损伤、房事过劳，或经期、产后六淫外侵致使气机阻滞、脏腑失和、阴阳失衡而引起。因此，在治疗时，要针对其整体病因进行全面的、综合的分析，辩证施治，才能使疾病得以真正的解决。
2、手术治疗 良性卵巢肿瘤患者，要切除患侧卵巢肿瘤，手术时一定要检查对侧的卵巢情况，如果对侧也有肿瘤则必须切除，同时做病理检查。但是术后易复发。恶性肿瘤者：手术是首选方法，其手术范围要广，一般都切除全子宫，双附件加大网膜。手术后还须进行化疗、放疗。
3、电极刀治疗 特别受患者青睐。该疗法主要是运用声像、影像三维扫描功能的导航仪，将盆腔内卵巢及囊肿立体定位，把微电极送入卵巢囊肿囊腔内，在测出囊腔内细胞成分及积淀性质后，吸出囊内积液，再由因子介入，通过电离作用，使囊肿病灶组织细胞核抑制失活，达到抑制囊肿的目的。
5、半保守手术 主要是切除子宫及子宫内膜异位病灶，保留卵巢功能。适用于45岁以下，并且无生育要求，或病灶的范围广泛，而且无法保留生育功能者，或合并有子宫肌瘤或子宫腺肌病者。
6、卵巢囊肿根治手术 是行全子宫及双侧附件切除术，不保留卵巢功能。如粘连严重行全子宫切除有困难时，可行次全子宫切除或仅切除双侧卵巢。适用于近绝经期，或虽年轻但病情严重者。
7、内外合治法 以内治法补血补气、扶正固本；以外治法逐瘀散结、驱寒行气。因为单以内治法逐瘀散结的话，必然要用到三棱，莪术等破血药，破血必伤血，伤血则血更虚，因此不可取；而单以外治法治疗的话，则不能补血补气，扶正固本，会使事倍功半。
生育年龄的女性最容易病发的卵巢囊肿是卵巢的功能性囊肿，它是因为卵巢本身或药物刺激造成的过度生理性反应所导致的。卵巢囊肿是威胁到女性身体健康，甚至性命攸关的最严重的恶性肿瘤之一。希望以上这些会对您的病情有帮助，祝您早日康复。