一般来说，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤的话，多为功能性囊肿，可以密切随访，即2－3个月检查一次，以后再根据情况调整检查间隔时间。若囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢肿瘤。卵巢囊肿的治疗方法有很多，除了不同的手术治疗外，还可以通过介入治疗。但有时也会出现不能切除的囊肿，不能切除的卵巢囊肿怎么治？
1、疼痛
疼痛为患者最大的痛苦，可先用一般止痛药，如阿斯匹林，可待因，仍无效，再交替给度冷丁，吗啡，但易成瘾，用任何止痛剂易均无效者可试用酒精注入脊髓膜腔。
2、腹水
每次排尽腹水后还可通过导管给药，但须注意腹水中含有大量蛋白类，大量排液应及时补充营养。
3、肠或输尿管梗阻
如患者一般情况好，可施行结肠腹壁，造口术或输尿管移植术，可解除患者的排泄障碍及由此引起的水电平衡紊乱，酸中毒等。