在诊断抑郁症的时候，医生往往会先要求患者进行一些身体检查，以排除与抑郁症相关的疾病或发现某些与抑郁症并存的疾病，主要包括以下这些项目。
血液生化检查 包括肾功能、肝功能、血脂胆固醇、电解质水平测定等，这些检查有助于医生了解患者的基本健康状况。
全血图 贫血、慢性感染等病症往往是导致人体出现无精打采、疲倦等压抑情绪的原因，全血图能帮助鉴别患者是否有这些相关疾病。
肾上腺检查 常用方法为脱氢表雄酮水平测定，脱氢表雄酮水平低下会导致人体出现无精打采、疲倦、酸痛不适、注意力不集中、心情抑郁等表现。
甲状腺功能测定 甲状腺功能亢进会导致人体出现情绪不稳定、焦虑、睡眠障碍等表现，而甲状腺功能低下则会导致人体出现懒惰、疲倦、注意力不集中、体重增加、嗜睡等表现。进行甲状腺功能测定可鉴别抑郁症与甲状腺功能异常。
性激素检查 性激素水平下降与抑郁情绪的发生有一定关系。男性睾酮水平下降，会引发抑郁症状；女性雌激素、孕激素失衡会造成情绪波动、抑郁心境等。
影像技术检查 对于疑似肿瘤病或占位性病变的患者，需要了解患者的颅内、心、肾、肝、乳腺、膀胱、胃、结肠等脏器的情况，常用CT扫描、核磁共振、超声波、X射线、纤维内镜等检查。
传染性疾病检查 某些传染病的发生往往会伴随不同程度的抑郁症状，所以有必要进行病毒性肝炎、艾滋病、梅毒等传染性疾病的检查。