肛瘘大部分肛瘘由肛门直肠脓肿破溃或切开排脓后形成，在愈合缩小的过程中，形成慢性感染性管道。
1、为预防和减少新生儿和小婴儿发生感染性肛瘘，必须注意肛门卫生。家长习惯在换尿布时顺手用尿布擦一下肛门和外阴，并且误认为尿布很干净，也很柔软，其实对新生儿和小婴儿来讲，尿布还是有些粗糙和不卫生的。
2、最好在便后用装有温水或硼酸水的小壶冲洗肛门和外阴，然后再用干净的棉花或软布轻轻擦干，这样就能减少肛门周围皮肤及外翻的直肠粘膜的损伤，达到预防感染的目的。
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