拔除灰指甲是灰指甲的治疗手段之一，有外科拔甲法和化学溶甲法两种方法。
外科拔甲就是在患者进行局部麻醉的情况下，用医用钳子夹住病甲直接拔除，此法治疗速度快，但损伤较大，在手术过程中出血多，麻醉药效过后会感觉疼痛，伤口愈合困难，患者比较难接受。并且如果没有很好地包扎处理，就有可能引起局部感染。
化学溶甲法采用40％的尿素软膏包裹病甲，每日换药一次，一般5~7天后，患病的甲板即可软化并与甲床分离，此时便可将病甲拔除。
由于致病真菌不仅存在于病甲中，甲床、甲周皮肤，甚至甲沟都有可能被真菌感染，因此单纯通过外科拔甲法无法彻底去除感染的真菌，灰指甲复发率很高。化学方法治疗时甲沟中的甲屑也不能完全去除，甲床及甲周被感染的皮肤也不能使用化学药剂，导致这些部位的致病真菌无法杀死，病甲祛除后同样易复发。
现在拔甲手术的治疗已经越来越少人用了，目前仅用于其他治疗方法不能达到很好效果的患者，拔甲后尚需抗真菌药物治疗，才能够更深入且彻底地把灰指甲治好。