关于原发性三叉神经痛的病因与发病机制众说纷纭，在古今中外的医学文献中，学者们各自提出了自己的观点，但直到今天，仍然没有明确的定论。
三叉神经痛是一种周围神经疾病，现代医学将三叉神经痛大体分为原发性三叉神经痛和继发性三叉神经痛两类。前者是指有临床症状，但检查未发现有明显的与发病有关的器质性或功能性病变；后者指有明显的器质性和（或）功能性病变。
研究人员根据动物实验、解剖、手术所见、病理学观察以及临床实践所得出的结论，对其原发性三叉神经痛的病因形成了以下几种观点：三叉神经脊束核抑制机能的受损是三叉神经痛发作的重要因素（即三叉神经痛的中枢病因学说）；周围神经的脱髓鞘变是三叉神经痛的病理基础（即三叉神经痛的周围病因学说)；还有有学者研究发现，机体免疫和生化因素的作用也与三叉神经痛的病因与发病机制密切相关。
Tips--何谓周围神经疾病
是指周围运动、感觉和自主神经的结构和功能障碍。周围神经包括嗅、视神经以外的脑神经与脊神经。周围神经纤维可分为有髓鞘和无髓鞘两种。脑神经和脊神经多属有髓鞘神经纤维，而自主神经属无髓鞘神经纤维。周围神经疾病的重要症状之一是疼痛。临床上，可分为神经痛和神经病两大类。神经痛是指受累的感觉神经分布区发生疼痛，而神经的传导功能正常，神经主质无明显变化，如原发性三叉神经痛。